阅读器(Readers)蛋白是非常重要的蛋白质,阅读器蛋白质能够识别特定位点的基团,识别阅读器蛋白质对于理解转译后修饰起到的生物学作用非常重要。光化学交联反应能够非常有效的研究阅读器蛋白,但是,目前使用的光化学反应探头的合成具有非常大的困难和挑战,光照射产生的氮烯、卡宾等高能量中间体物种可能导致非特异性交联反应。
有鉴于此,西湖大学吴明轩等报道二甲基锍能够模拟甲基赖氨酸,与特定阅读器蛋白结合,并且通过紫外光照射与口袋内的色氨酸位点发生交联反应。
本文要点
(1)
这种光化学交联反应基于蛋白为模板的锍基-吲哚之间的σ-π形式供体-受体相互作用,通过这种方法能够对色氨酸位点实现位点选择性,保证了甲基赖氨酸阅读器蛋白的正交生物交联。
(2)
这种方法能够进一步应用于从复杂的细胞样品发现甲基赖氨酸阅读器蛋白。此外,这种光化学交联反应级数能够拓展用于其他微环境进行位点选择性和特异性的色氨酸交联。
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Feng, F., Gao, Y., Zhao, Q. et al. Single-electron transfer between sulfonium and tryptophan enables site-selective photo crosslinking of methyllysine reader proteins. Nat. Chem. (2024).
DOI: 10.1038/s41557-024-01577-y
https://www.nature.com/articles/s41557-024-01577-y