细胞分泌许多对健康生物体功能至关重要的生物活性分子。然而,随着时间的推移,需要可扩展的方法将单个细胞分泌物与其转录状态联系起来。近日,加利福尼亚大学Dino Di Carlo、Kathrin Plath使用SEC-seq将生长因子分泌物和单个细胞的转录组关联起来。
本文要点:
1) 作者通过开发和使用分泌编码的单细胞测序(SEC-seq),并利用具有亚纳米腔(纳米瓶)的水凝胶颗粒来捕获单个细胞及其分泌物,从而同时测量了数千个血管内皮生长因子A(VEGF-A)的分泌和转录组。
2) 研究表明,VEGF-A的分泌在整个细胞群体中是不均匀的,并且与其转录水平的相关性很差。SEC-seq能够鉴定与特定分泌状态相关的基因特征,并促进机制研究、分泌亚群的分离和调节细胞分泌方法的开发。
Shreya Udani et.al Associating growth factor secretions and transcriptomes of single cells in nanovials using SEC-seq Nature Nanotechnology 2023
DOI: 10.1038/s41565-023-01560-7
https://doi.org/10.1038/s41565-023-01560-7