调控基因组的三维（3D）组织为基因调控提供了拓扑基础，但尚不清楚哺乳动物基因组中的多种调控机制如何在单个细胞内相互作用。为了解决这一问题，北京大学汤富酬开发了scNanoHi-C，它可通过纳米孔测序来探索单细胞内全基因组近端高阶染色质接触。
本文要点：
1) scNanoHi-C可以有效描述3D染色质结构，并在单个细胞中区分结构亚型。该方法还可用于检测基因组变异，包括拷贝数变异和结构变异，以及构建单细胞基因组的从头组装。
2) 此外，在整个基因组的活性染色质区域中存在高阶染色质结构，并且在单个细胞中具有增强子与其靶启动子之间的多向相互作用。总之，scNanoHi-C为在单细胞水平上研究高阶3D基因组结构提供了新的机会。
Wen Li et.al scNanoHi-C: a single-cell long-read concatemer sequencing method to reveal high-order chromatin structures within individual cells Nature Methods 2023
DOI: 10.1038/s41592-023-01978-w
https://doi.org/10.1038/s41592-023-01978-w
