目前的细胞内蛋白质分析方法大多需要分离特定的细胞器或改变细胞内环境。然而，由于蛋白质通常会与离子、核酸和其他蛋白质形成复合物，蛋白质的功能往往由其天然微环境决定。中科院大连化物所张丽华和杨开广展示了一种原位交联和分析活细胞中线粒体蛋白的方法。

本文要点

（1）作者使用用二甲基二十八烷基溴化铵（DDAB）功能化的聚乳酸-乙醇酸（PLGA）纳米颗粒将蛋白质交联剂递送到线粒体中，随后使用质谱法分析交联的蛋白质。

（2）使用这种方法，作者总共识别了74对STRING数据库中不存在的蛋白质-蛋白质相互作用。更有趣的是，作者关于线粒体呼吸链蛋白的数据( ~ 94%）也与这些蛋白质的实验或预测的结构分析一致。因此，该研究为在细胞器的天然微环境下原位确定蛋白质分析提供了一个有前景的技术平台。

Yuwan Chen, et al. Targeted cross-linker delivery for the in situ mapping of protein conformations and interactions in mitochondria. Nature Communications. 2023

DOI：10.1038/s41467-023-39485-3

https://www.nature.com/articles/s41467-023-39485-3