生物分子缩合过程是活细胞在时间和空间上组织生物分子的基本机制。而这些过程可以导致无膜细胞器的形成,从而使细胞能够在受控的局部环境中执行不同的生物化学过程,进而为它们提供相对于膜结合细胞器实现的额外空间控制。近日,剑桥大学Tuomas P. J. Knowles综述研究了生物分子缩合物的理论和数据驱动方法。
本文要点:
1) 在人们对生物分子缩合分子机制的探索研究中,理论计算方法可以达到实验技术难以达到的分辨率和尺寸规模,从而为研究生物分子缩合过程提供了独特角度。作者重点介绍了三种类型的实验室方法:理论方法、物理驱动模拟和数据驱动的机器学习方法。
2) 作者回顾了使用这些工具在所有三个领域探测生物分子缩合的最新进展,并概述了每种方法的关键优势和局限性。作者进一步讨论了需要解决的关键挑战,以便更全面地了解生物分子缩合过程中的分子驱动力及其在健康和疾病中的生物学作用。
Kadi L. Saar et.al Theoretical and Data-Driven Approaches for Biomolecular Condensates Chem. Rev. 2023
DOI: 10.1021/acs.chemrev.2c00586
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.chemrev.2c00586