分子或蛋白质与寡核苷酸的结合可以提高它们的功能和治疗能力。然而,此类修饰通常仅限于寡核苷酸的 5' 和 3' 端。
近日,奥尔胡斯大学Kurt V. Gothelf报道了一种方法直接应用于基于亚磷酰胺的自动化 SPOS,它允许在 DNA 寡核苷酸的骨架中轻松且廉价地添加化学处理和修改。
文章要点
1)该方法添加了一种氨基磷酸酯修饰,并且只需要一种亚磷酰胺,它可以在一个合成步骤中从市售的起始材料中制备出来。插入该亚磷酰胺后,应用氧化偶联条件,使用碘和胺进行选择的修饰,从而生成所需的亚磷酰胺。之后,可以继续标准 SPOS,直到准备好所需的寡核苷酸。
2)寡核苷酸的 5' 和内部氨基磷酸酯修饰都是可行的。与目前使用的在寡核苷酸主链上连接化学手柄的方法相比,磷酸盐的修饰对 DNA 的天然物理化学特性的干扰很小。
3)在确定最佳条件后,引入了多种具有仲胺或伯胺的不同化学处理方法,一般氧化偶联产率超过 80%。在这里,安装了胺、炔烃和叠氮化物功能,并使用标准化寡核苷酸化学用荧光团成功地进一步修饰了这些功能。
4)在生理相关 pH 和 pH 5.5 下研究了氨基磷酸酯修饰的寡核苷酸的水解稳定性。结果发现,由仲胺制备的 5' 氨基磷酸酯修饰在较低的 pH 值下被特异性水解,导致天然 DNA 主链的释放。对于具有较大修饰的 5' 氨基磷酸酯(例如抗体或荧光团)也发现了这种情况,研究人员认为这对于使用肽或蛋白质偶联物特异性递送 ASO 具有潜在的意义。
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Rikke A. Hansen, et al, Insertion of Chemical Handles into the Backbone of DNA during Solid-Phase Synthesis by Oxidative Coupling of Amines to Phosphites, Angew. Chem. Int. Ed. 2023, e202305373
DOI: 10.1002/anie.202305373
https://doi.org/10.1002/anie.202305373