生物在许多关键过程中,包括DNA复制、转录和翻译、化学传感和形态发生等,都得益于精细的分子敏感性。在热力学平衡时,敏感性的基本生物物理机制是协同结合,因此可以证明希尔系数(一种敏感性度量)不能超过结合位点的数量。近日,来自密歇根大学生物物理系的Jordan M. Horowitz等人发现,对于任何动力学方案,在热力学平衡或远离热力学平衡时,一个非常简单的结构量(即扰动支撑的大小),总是会限制有效希尔系数。
文章要点:
1) 该研究研究了这一界限如何揭示并统一各种敏感机制,包括动力学校对和针对大肠杆菌鞭毛运动开关提出的非平衡Monod-Wyman-Changeux(MWC)模型,在每种情况下都代表了实验观察和研究所记录的模型之间的简单、精确的桥梁;
2) 此外,在寻求使支持结合饱和的机制时,该研究发现了一种非平衡结合机制,即嵌套滞后,结合位点的数量呈指数级敏感,这对深入理解基因调控模型和生物分子凝聚物的功能具有重要意义。
参考资料:
Owen, J.A., Horowitz, J.M. Size limits the sensitivity of kinetic schemes. Nat Commun 14, 1280 (2023).
DOI: 10.1038/s41467-023-36705-8
https://doi.org/10.1038/s41467-023-36705-8